در سال ۱۹۸۹ شرکت هواپیمایی پگاسوس با مشارکت شرکت نت‌ایر و سیلک‌ایر و همکاری شرکت هواپیمایی ایر لینگاس تاسیس شد و در سال ۱۹۹۰ با دو فروند بوئینگ پرواز های خود را آغاز کرد. در سال ۱۹۹۴ سهام این شرکت هواپیمایی به شرکت ترکی فروخته شد و 10 فروند بوئینگ را به خطوط هوایی خود اضافه نمود.

هواپیمایی پگاسوس در ژوئیه  ۲۰۱۲ بیش از40٪ درصد از سهام هواپیمایی قرقیزستان را  خریدار نمود و در سال ۲۰۱۳ اولین هواپیمای خود را با نام پگاسوس آسیا معرفی کرد و  در سال‌های 2013 و 2014 ارزان‌ترین ایرلاین اروپا شناخته شد، دفتر مرکزی این شرکت هواپیمایی ارزان‌قیمت در پندیک، استانبول واقع است و سفر با این هواپیما برای سفر به ترکیه بسیار مقرون به صرفه است. این شرکت هواپیمایی با در اختیار داشتن ۵۲ فروند هواپیمای جت مسافربری به بیش از 70 مقصد سهم عظیمی در حمل و نقل هوایی ترکیه دارد. پرواز های داخلی ایرلاین ترکیه شامل استانبول، آنتالیا،آلانیا،  ازمیر، بدروم، آدانا، هانای، سیواس و ... می باشدو پرواز های خارجی آن شامل شهر های اروپایی آمستردام، آتن، بلگراد، کپنهاک، وین، زوریخ، فرانکفورت، هامبورگ و...می شود. حداقل بار مجاز در پروازهای داخلی ترکیه ۱۵ کیلوگرم و در پروازهای خارجی ۲۰ کیلوگرم است.